W roku 1998 ukończył Akademię Medyczną w Warszawie, w latach 1999-2001 odbył staż podyplomowy na Uniwersytecie w Cincinnati w USA. W latach 2001-2012 pracował jako adiunkt w Zakładzie Genetyki Medycznej Instytutu Matki i Dziecka w Warszawie.Zatrudniony jako adiunkt w Zakładzie Genetyki Medycznej Warszawskiego Uniwersytetu Medycznego (WUM), a także konsultant w oddziałach Szpitala Pediatrycznego Uniwersyteckiego Centrum Klinicznego WUM, gdzie prowadzi Poradnię Genetyczną.
Zainteresowania naukowe Krzysztofa Szczałuby ogniskują się głównie wokół zagadnień neurorozwojowych, w szczególności patogenezy niepełnosprawności intelektualnej, padaczki, autyzmu i wad rozwojowych OUN. Jest autorem ponad 60 publikacji znajdujących się na liście IF oraz wielu prac kazuistycznych i doniesień zjazdowych. Dr Krzysztof Szczałuba czynnie angażuje się w wielospecjalistyczną opiekę nad dziećmi z zespołami genetycznie uwarunkowanymi.